受美国近代实验心理学流派的影响，心理学系强调心理学基础理论的教学与研究，开设的课程侧重自然科学，强调用科学实验法研究心理学。心理学系还建立了普通心理学实验室和实验心理学实验室，研究重点放在心理学基础理论的研究。1932年，设立了心理学研究所（后改为研究部），开始招收研究生。1934年院系调整定型时，清华大学心理学系是清华大学理学院六大系之一。
　　在西南联大时期，清华大学心理学系并入联大文学院哲学心理学系，改为心理学组，仍兼受清华理学院领导。1952年院校调整以后，心理学系随理学院并入北京大学。

　　 1979年10月，清华大学建立教育研究室（后改为教育研究所），下设应用心理学研究室。1987年，清华大学建立了高校最早的心理咨询中心。2000年教育研究所设立了心理学研究室。2003年拥有了应用心理学系硕士点。2006年4月，清华大学人文社会科学学院批准成立心理学与认知科学研究中心。2007年12月，清华大学成立由谢维和副校长为组长，李强、钱颖一、彭凯平等为成员的心理学筹备工作小组。2007年底开始，清华大学与加州大学伯克利分校建立战略合作关系，2008年5月，在威盛中国芯集团资助下成立“清华大学－伯克利心理学研究中心”，推动清华大学心理学系复建，同时伯克利加州大学在教学师资和科研上支持清华大学心理学系的发展。2008年5月26日，凝聚着几代人努力的清华大学心理学系正式恢复建立。

　　清华大学心理学系曾经有过辉煌的历史，为我国培养了一大批心理学的领军人物，当时在心理学系任教的著名学者有唐钺、孙国华、周先庚、沈履、陈立等人，他们著书立说，授业解惑，不仅是中国心理学史的缔造者，还为新中国培养了一大批心理学家，同时为奠定心理学作为自然科学的发展方向起到不可磨灭的作用。心理学系几经风雨，其间还培养了一批著名科学家。如，我国家畜人工授精技术的开拓者和传播者，1931级的郑丕留；现代试管婴儿之父、美国科学院院士，1933级的张民觉；著名心理学家，1935级的曹日昌，我国最早将辩证唯物主义应用于心理学研究的倡导者之一，为我国心理学科的兴建和发展做出了重要贡献。他们将清华精神带向世界，并为清华人树立了光辉的榜样。
　 　作为研究人类心理过程和行为的科学，心理学日益成为其他人文社会科学的基础学科，它的影响涉及到经济学，政治学，社会学，哲学，教育学，管理学等等领域。简言之，只要涉及到人的活动，心理学的研究知识和方法都会对人们有所启迪。

　　复建后的心理学系以基础研究为中心的文理交融的心理学学科，以认知神经科学、临床与心理咨询和社会心理学三大学科方向为重点。学科设置上包括基础心理学和应用心理学两个专业。其中，基础研究包括知觉、情绪、人格、社会行为和团体关系等领域；应用研究包括将基础研究领域的研究成果推广到与人的日常生活相一致的领域，比如家庭、教育、工作、体育、工业、宗教和健康等方面。既与国家的心理学专业教育设置相吻合，同时也与心理学学科的性质相匹配。

　　复建后的第一任系主任是彭凯平教授，副系主任樊富珉教授。

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